Om het werk voor de opgevangen zeehonden optimaal te kunnen uitvoeren, is de Zeehondencrèche gebouwd en uitgerust als een ziekenhuis. Het werken met zieke en verzwakte - en daardoor kwetsbare - dieren uit verschillende gebieden maakt een honderd procent betrouwbare quarantaine noodzakelijk: ziekten zouden anders overgedragen kunnen worden. Er zijn in de crèche twaalf quarantaine-ruimtes, die volledig van elkaar zijn gescheiden. Ze hebben een speciale luchtbehandeling en ook de waterzuivering is gescheiden. Ook de zes grote bassins hebben elk een zelfstandig waterzuivering-systeem. Van iedere zeehond die binnenkomt, wordt bloed afgenomen, dat in het eigen laboratorium met speciale apparatuur wordt onderzocht. Voor aanvullende onderzoeken wordt bloed soms naar externe laboratoria gestuurd. Indien noodzakelijk, kan in de crèche van een zeehond een röntgenfoto worden gemaakt. En ook echo-scan en andere medische apparatuur behoort tot het gereedschap van de dierenarts.
Daarnaast maakt de crèche gebruik van een aparte sectieruimte, waar dood gevonden zeehonden, bruinvissen en dolfijnen door de dierenartsen van de crèche (vaak samen met specialisten) worden onderzocht, om voor zover mogelijk de doodsoorzaak vast te stellen. Resultaten van dergelijk onderzoek zijn onmisbaar voor de continue verbetering van de zorg waar de crèche naar streeft.
Infrastructuur